文档数据库（如 MongoDB）和关系数据库（如 PostgreSQL）的主要区别在于数据组织、查询灵活性和可扩展性。文档数据库将数据存储为类似 JSON 的文档，具有动态模式，非常适合非结构化或不断演变的数据。关系数据库使用具有固定模式的表，并通过外键强制关系，这适用于具有严格一致性需求的结构化数据。选择取决于项目对模式灵活性、事务保证和可扩展性的要求。
第一个权衡是模式灵活性与数据完整性。文档数据库允许开发人员存储数据，而无需预定义的模式，从而实现快速迭代。例如，可以存储具有不同属性的产品目录（例如，书籍与电子产品的不同字段），而无需更改全局模式。但是，如果不小心管理，这种灵活性可能会导致数据格式不一致。关系数据库强制执行严格的模式，通过数据类型和外键等约束来确保数据一致性。这对于数据准确性至关重要的金融系统等应用程序至关重要，但模式更改需要迁移，这可能会减慢开发速度。
另一个关键区别是查询能力和事务支持。关系数据库擅长于涉及多个表连接的复杂查询，这对于报告或具有互连数据的应用程序（例如，连接订单、用户和库存的电子商务平台）非常有用。它们还支持 ACID 事务，确保跨表的可靠更新。文档数据库通常缺乏原生连接支持，需要非规范化或应用程序端逻辑来组合数据，这增加了复杂性。虽然某些文档数据库为单个文档提供事务支持，但多文档事务的鲁棒性较差。例如，社交媒体应用程序可能会优先考虑用户帖子的快速写入（使用文档数据库），而不是帖子和评论之间的事务一致性。
最后，可扩展性模式不同。文档数据库专为横向扩展而设计，将数据分布在集群中以处理高读/写工作负载（例如，实时分析平台）。关系数据库传统上是纵向扩展（升级硬件），或者使用有限的横向扩展和分片，管理起来很复杂。但是，关系数据库通常在分布式环境中提供更强的一致性保证。混合方法，例如使用关系数据库处理事务数据，使用文档数据库处理用户生成的内容，可以根据具体用例平衡这些权衡。