本体在知识图谱中扮演着构建数据结构和定义数据含义的基础性角色。本体的核心是描述实体类型（类）、其属性以及它们之间关系的正式模型。它们充当模式或蓝图，确保数据表示的一致性。例如，在一个关于电影的知识图谱中，本体可以定义诸如 Movie（电影）、Actor（演员）和 Director（导演）之类的类，以及诸如 starredIn（主演）或 directedBy（导演）之类的关系。如果没有本体，图谱将缺乏对这些概念如何相互关联的共同理解，从而导致歧义和数据脱节。
本体的一个主要实际好处是它们能够强制执行逻辑约束并实现自动化推理。例如，本体可能指定一个 Person（人）不能同时是同一部电影的 Actor（演员）和 Director（导演），除非明确说明；或者规定 publishedDate（发布日期）属性必须是一个有效的时间戳。Web Ontology Language (OWL) 等工具允许开发者编码这些规则，然后可以使用 Pellet 或 HermiT 等推理机进行验证。这确保了数据质量，并有助于发现隐藏的关系。例如，如果本体将 Parent（父/母）定义为传递关系（例如，如果 Alice 是 Bob 的父/母，且 Bob 是 Charlie 的父/母，则可以推断出 Alice 是 Charlie 的父/母），知识图谱可以自动推导出这些联系，而无需手动输入。
对于开发者而言，本体简化了查询、集成和维护等任务。通过提供统一的词汇表，它们使得使用 SPARQL 等语言进行精确查询成为可能。例如，一个查找由 Christopher Nolan 执导的所有电影的查询依赖于本体中 directedBy（导演）关系的定义一致性。本体还有助于整合来自不同来源的数据集。如果一个数据集使用 Writer（作者）而另一个使用 Author（作者），本体可以将它们映射到同一个类。RDF Schema (RDFS) 等框架和 Protégé 等工具帮助设计和管理本体，即使对于缺乏形式逻辑深厚专业知识的团队也易于使用。简而言之，本体将原始数据转化为连贯、可重用的知识库。