使用开源软件 (OSS) 具有显著的优势，但也带来开发者和组织必须解决的挑战。这些挑战主要围绕维护责任、安全风险和兼容性问题。虽然 OSS 通常可以免费使用，但其去中心化的性质和缺乏正式的支持结构可能会造成意想不到的障碍。
一个主要的挑战是依赖社区驱动的维护和支持。与拥有专门团队的商业软件不同，开源项目依赖于贡献者，他们可能会优先考虑自己的需求或随着时间的推移放弃项目。例如，像 OpenSSL 这样的关键库在 Heartbleed 漏洞暴露系统性风险之前，多年来面临资金不足和人员短缺的问题。使用 OSS 的组织必须投资于内部专业知识来维护和修补依赖项，否则可能长期面临安全漏洞。此外，解决问题通常需要筛选论坛、文档或源代码，这会减慢开发时间。
安全是另一个令人担忧的问题。虽然许多项目都有活跃的社区，但不能保证及时披露漏洞或补丁。例如，2021 年的 Log4j 漏洞表明，广泛使用的 OSS 组件如何可能存在多年未被注意到的关键缺陷。开发人员必须使用 Snyk 或 Dependabot 等工具主动监控依赖项，并随时了解更新。法律合规也存在风险，因为 OSS 许可（例如，GPL、Apache）施加了特定的义务。意外地混合了不兼容许可下的代码（例如，将 GPL 许可的代码与专有软件结合）可能导致法律纠纷或强制披露专有代码。
最后，集成和长期可持续性可能存在问题。开源工具可能与现有系统缺乏兼容性，或者需要自定义以适应特定的工作流程。例如，使用 Python 库构建的项目可能会在依赖项意外更新时中断，从而需要耗时的重构。如果不再维护关键组件，被放弃的项目（例如，npm 中的 left-pad）也会扰乱工作流程。团队必须权衡维护分支或迁移到替代方案的成本与首先使用 OSS 的好处。平衡这些权衡对于有效利用开源同时减轻风险至关重要。