SaaS 平台通过结合配置选项、API 和扩展框架来处理定制化。大多数平台提供内置工具，无需更改代码即可调整用户角色、工作流程或 UI 布局等设置。例如，一个 SaaS 应用程序可能允许管理员为数据输入定义自定义字段，配置审批流程，或使用公司徽标对界面进行品牌定制。这些低代码/无代码功能允许用户根据自身需求调整平台，同时保持升级兼容性，因为核心系统逻辑保持不变。例如，Salesforce 使用其声明式工具使管理员能够创建自定义对象并自动化业务规则，确保定制化不会干扰平台更新。
为了进行更深度的定制化，SaaS 平台通常会公开 API 和 Webhook。API 允许开发者集成外部系统、自动化任务或以编程方式操作数据。一个常见的例子是 REST API，它允许从 SaaS CRM 获取客户数据以与内部计费系统同步。Webhook 启用事件驱动的工作流程，例如在支持工单更新时触发 Slack 通知。Shopify 等平台提供 GraphQL 和 REST API 来管理店铺、库存和订单，赋予开发者精细的控制权。此外，一些 SaaS 工具支持通过无服务器函数（例如，AWS Lambda for Netlify）或沙盒环境嵌入自定义代码。例如，Twilio 的 Functions 允许开发者部署 JavaScript 片段来修改呼叫处理逻辑。
通过插件或模块化架构进行扩展是另一种关键方法。许多 SaaS 平台支持第三方开发者构建附加组件的应用市场。例如，WordPress 插件可以在不修改底层代码库的情况下扩展核心 CMS 功能。类似地，Zendesk 等平台允许开发者使用标准化框架创建与其帮助台软件集成的应用。为了维护安全性和稳定性，SaaS 提供商通常将自定义代码隔离在容器或无服务器环境中。然而，挑战依然存在，例如在推出更新时确保向后兼容性，或管理过度定制带来的性能开销。例如，Salesforce 使用元数据驱动的开发将自定义配置与核心平台分离，最大程度地减少升级过程中的冲突。开发者必须权衡灵活性与维护可伸缩、可维护系统的利弊。